公司设立董事会,董事会成员5名。另设监事3名,总经理1名,副总经理3名。

公司下属“九个职能部门、九个业务部门”:九个职能部门为总经理办公室、党群人事部、监察审计室、科技发展部、保密保卫办公室、经营计划部、生产管理部、质量安全部、财务部。九个业务部门为系统集成室、信息产品室、水声导航室、惯性导航室、航海运营中心、生产制造部、产品服务部,金属制品部和Smif公司。